او عضو هیات‌مدیره هما بوده و مسئولیت‌هایی مانند مدیرکل پژوهش و بهسازی منابع انسانی هما، ریاست مرکز آموزش و بهسازی منابع انسانی هما، ریاست ارشد تضمین کیفیت در مهندسی و تعمیرات هما و همچنین دبیری انجمن علمی حمل و نقل هوایی کشور را در کارنامه خود دارد.
عباس آخوندی وزیر راه و شهرسازی در حکمی فرزانه شرفبافی را به عنوان سرپرست جدید شرکت هواپیمایی جمهوری اسلامی ایران (ایران ایر) منصوب کرد و شرفبافی در تاریخ ۱۲ مهر ۱۳۹۶ با تصویب هیات دولت به عنوان عضو هیات مدیره و مدیرعامل شرکت هواپیمایی جمهوری اسلامی ایران منصوب شد.
دکتر شرفبافی دارای بیش از بیست سال سابقه فعالیت در هما بوده و پیشتر به عنوان عضو هیات‌مدیره و رییس مرکز آموزش و بهسازی منابع انسانی هما فعالیت داشت.
توجه ویژه به آموزش منابع انسانی، استقرار مدیریت عملکرد، بهبود روش‌های بازرگانی و بازاریابی و گسترش شبکه پروازی ، بازنگری و بازیابی صندوق بازنشستگی هما، ارتقای فرهنگ سازمانی و ارتقای اخلاق و مشتری‌مداری از مهمترین برنامه‌های دکتر شرفبافی است.
سوابق فعالیت‌های آموزشی و سازمانی دکتر فرزانه شرفبافی به شرح زیر است:
- دارای مدرک کارشناسی ارشد و دکتری هوافضا از دانشگاه صنعتی‌شریف
-ارایه رساله دکتری با عنوان چگونگی پیری هواپیماها وابداع رابطه ریاضی اثبات و روش محاسبه تنش در سازه هواپیما
- ساخت سیمولاتور ارابه فرود هواپیمای بویینگ در مقطع کارشناسی ارشد
- ساخت دستگاه سنجش خمش بال هواپیما در مقطع کارشناسی وکسب رتبه اول مهندسی مکانیک ایران دررابطه با این موضوع
- برترین پژوهشگر وزارت راه و ترابری
- برترین مدیر پژوهشی وزارت راه و شهرسازی.
-ارایه مقالات متعدد پژوهشی در سطح بین المللی مثل ایکائو و یاتا
- مدرس مباحث مربوط به هواپیماهای فوکر و بویینگ
-رییس ارشد تضمین کیفیت در مهندسی و تعمیرات "هما"
- دبیر انجمن علمی حمل و نقل هوایی
- مدیرکل پژوهش و بهسازی منابع انسانی "هما"
-کارشناس رسمی دادگستری در رشته صنایع هوایی و فضایی و سر ممیز سیستم های مدیریتی کلان
- بیش از پنج سال فعالیت به عنوان رییس مرکز آموزش و بهسازی منابع انسانی
برخی دیگر از فعالیت‌های دکتر شرفبافی در صنعت حمل و نقل هوایی کشور:
- اولین بانوی بصیر کشور
-اولین بانوی معاون مدیرعامل و اولین بانوی عضو هیات مدیره هما
-اولین بانوی تاثیر گذار بر فرهنگ هوانوردی کشور
- اولین بانوی معلم هواپیما
-اولین بانوی فارغ التحصیل هوافضا درایران
-اولین بانوی دبیر انجمن علمی حمل و نقل هوایی ایران.
-اولین مدرس سیستم های مدیریت ایمنی با تاییدیه یاتا